Αρμοδιότητες του Τμήματος Ποιότητας και Διαχείρισης Έργων και Προγραμμάτων είναι:
- Η παρακολούθηση της εξέλιξης νέων τεχνολογιών και η αξιοποίησή τους για τις ανάγκες της υπηρεσίας.
- Η συστηματική παρακολούθηση και αξιολόγηση των διαδικασιών και λειτουργιών του Α.Σ.Ε.Π.
- Η υποβολή προτάσεων για τη βελτιστοποίηση των διαδικασιών, καθώς και η τεκμηρίωση και προτυποποίησή τους.
- Ο σχεδιασμός και η παρακολούθηση δεικτών ποιότητας των διαδικασιών της Αρχής.
- Η επεξεργασία προτάσεων για έργα και προγράμματα χρηματοδοτούμενα από τον τακτικό προϋπολογισμό ή συγχρηματοδοτούμενα και η μέριμνα για την υλοποίησή τους.
- Η εκπόνηση αναφορών για την πορεία εκτέλεσης των έργων/προγραμμάτων, τα οποία υλοποιούνται από ή/και για το Α.Σ.Ε.Π.
- Η διαμόρφωση λειτουργικού πλαισίου διαχείρισης έργων για την ομαλή ένταξή τους στη λειτουργία του Α.Σ.Ε.Π.
- Η τήρηση του αρχείου των συγχρηματοδοτούμενων έργων.